Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGAP1Q07960 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGAP1Q07960 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms