Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 YDR344CYDR344C 444 nt0.63□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YOR282WYOR282W 321 nt0.63□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 snR36snR36 182 nt0.63□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 NOP9YJL010C 2001 nt0.63□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 SMC1YFL008W 3678 nt0.63□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YFL063WYFL063W 456 nt0.62□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 COG8YML071C 1824 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 MCM10YIL150C 1716 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 PMP1YCR024C-A 123 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 PAA1YDR071C 576 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 ECM12YHR021W-A 456 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YIL032CYIL032C 357 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YKL118WYKL118W 312 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 GEA2YEL022W 4380 nt0.61□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YJR029WYJR029W 5268 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 ALG13YGL047W 609 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 RPS27BYHR021C 249 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 RPL39YJL189W 156 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 CMC4YMR194C-B 222 nt0.6□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 ASE1YOR058C 2658 nt0.59□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YFL032WYFL032W 321 nt0.59□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YGL149WYGL149W 306 nt0.59□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 QCR9YGR183C 201 nt0.59□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 YOR218CYOR218C 420 nt0.59□□□□□ -2.31
RDS3Q06835 VIK1YPL253C 1944 nt0.59□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 BFR2YDR299W 1605 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 snR60snR60 104 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 NHP2YDL208W 471 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YDR413CYDR413C 576 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YER097WYER097W 330 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YKL136WYKL136W 399 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YNL211CYNL211C 261 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 IES4YOR189W 351 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 UTP20YBL004W 7482 nt0.58□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 RPL26BYGR034W 384 nt0.57□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 CSE2YNR010W 450 nt0.57□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 SGF11YPL047W 300 nt0.57□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 STE5YDR103W 2754 nt0.56□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 SEC1YDR164C 2175 nt0.55□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.55□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.54□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.54□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.54□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YMR160WYMR160W 2451 nt0.54□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 RKR1YMR247C 4689 nt0.53□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.53□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YNL028WYNL028W 318 nt0.53□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 YOL014WYOL014W 375 nt0.53□□□□□ -2.32
RDS3Q06835 SEC8YPR055W 3198 nt0.53□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 LTE1YAL024C 4308 nt0.52□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 HAL9YOL089C 3093 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 NPR2YEL062W 1848 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 CHS6YJL099W 2241 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.51□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.5□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.5□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.5□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.49□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.49□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.49□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YOR015WYOR015W 360 nt0.49□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 RAD61YDR014W 1944 nt0.48□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.48□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 BEM3YPL115C 3387 nt0.48□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 FYV10YIL097W 1551 nt0.48□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 PRP5YBR237W 2550 nt0.47□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.47□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 snR190snR190 190 nt0.47□□□□□ -2.33
RDS3Q06835 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.46□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.46□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YML002WYML002W 2214 nt0.45□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.45□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.45□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YSP1YHR155W 3687 nt0.45□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 snR65snR65 100 nt0.44□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 Q0142Q0142 177 nt0.44□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.44□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.44□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.44□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.44□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 OST4YDL232W 111 nt0.43□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YGL052WYGL052W 306 nt0.43□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 COX5BYIL111W 456 nt0.43□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YLR282CYLR282C 342 nt0.43□□□□□ -2.34
RDS3Q06835 YPR092WYPR092W 306 nt0.43□□□□□ -2.34
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