Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GABPAQ06546 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABPAQ06546 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms