Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DEUP1Q05D60 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DEUP1Q05D60 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms