Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKCDQ05655 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms