Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
CHRNEQ04844 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHRNEQ04844 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms