Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

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Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YOR376WYOR376W 369 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 NUP188YML103C 4968 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 SEC5YDR166C 2916 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YAR009CYAR009C 3591 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 APQ12YIL040W 417 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 HUG1YML058W-A 207 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 CUL3YGR003W 2235 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 MYO1YHR023W 5787 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YIR044CYIR044C 186 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YDL206WYDL206W 2289 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 IFH1YLR223C 3258 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 AZF1YOR113W 2745 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 CDC39YCR093W 6327 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YOR345CYOR345C 351 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN11Q04712 MCM10YIL150C 1716 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 BLI1YKL061W 342 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 PTP2YOR208W 2253 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 CDC25YLR310C 4770 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YKU70YMR284W 1809 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YNL198CYNL198C 303 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 FIG4YNL325C 2640 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 SPT7YBR081C 3999 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 ROM2YLR371W 4071 nt1.2□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 APL1YJR005W 2103 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 ALY2YJL084C 3141 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 VAM6YDL077C 3150 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 SET3YKR029C 2256 nt1.19□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 BUD3YCL014W 4911 nt1.18□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.18□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YDL196WYDL196W 330 nt1.18□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 SIP4YJL089W 2490 nt1.18□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 APL3YBL037W 3078 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 STO1YMR125W 2586 nt1.17□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.16□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.16□□□□□ -2.22
RRN11Q04712 GEA2YEL022W 4380 nt1.15□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.15□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.15□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 SWI4YER111C 3282 nt1.14□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YNL211CYNL211C 261 nt1.14□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 MMS4YBR098W 2076 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 OLI1Q0130 231 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YJL150WYJL150W 303 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 RPL33BYOR234C 324 nt1.13□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 SEC3YER008C 4011 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YLL054CYLL054C 2532 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 AIM44YPL158C 2277 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YLL020CYLL020C 306 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 NUP145YGL092W 3954 nt1.12□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YJR029WYJR029W 5268 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 STB6YKL072W 2301 nt1.11□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 PAA1YDR071C 576 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 RPS30BYOR182C 192 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 EAF1YDR359C 2949 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 ASE1YOR058C 2658 nt1.1□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 PAN2YGL094C 3348 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 ISD11YER048W-A 285 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 ULI1YFR026C 510 nt1.09□□□□□ -2.23
RRN11Q04712 COY1YKL179C 2040 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YOR225WYOR225W 330 nt1.08□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 SCC2YDR180W 4482 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YNL337WYNL337W 255 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 WAR1YML076C 2835 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 UTP20YBL004W 7482 nt1.07□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 DOP1YDR141C 5097 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 PMP1YCR024C-A 123 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YEL014CYEL014C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 COX12YLR038C 252 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 snR46snR46 197 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YPR117WYPR117W 7470 nt1.06□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 CMC4YMR194C-B 222 nt1.05□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 BEM2YER155C 6504 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.04□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 snR52snR52 92 nt1.03□□□□□ -2.24
RRN11Q04712 HAL9YOL089C 3093 nt1.02□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 NOP9YJL010C 2001 nt1.02□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YJL182CYJL182C 318 nt1.02□□□□□ -2.25
RRN11Q04712 YGR151CYGR151C 336 nt1.01□□□□□ -2.25
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