Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBXN1Q04323 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBXN1Q04323 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms