Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ERCC6Q03468 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms