Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TNFRSF17Q02223 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms