Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRSF2Q01130 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRSF2Q01130 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms