Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD1P98174 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD1P98174 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD1P98174 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD1P98174 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms