Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED6P86452 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED6P86452 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms