Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX6P78412 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX6P78412 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX6P78412 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX6P78412 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
IRX6P78412 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
IRX6P78412 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX6P78412 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms