Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC5P78333 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC5P78333 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC5P78333 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC5P78333 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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