Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSNK2A1P68400 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSNK2A1P68400 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms