Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTA2P62736 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms