Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF6P62330 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF6P62330 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms