Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5BP61020 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5BP61020 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms