Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF4A1P60842 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF4A1P60842 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms