Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
ROMO1P60602 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms