Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLF3P57682 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF3P57682 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms