Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAG2P55895 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAG2P55895 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAG2P55895 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAG2P55895 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAG2P55895 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAG2P55895 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAG2P55895 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms