Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFDNP55196 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFDNP55196 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFDNP55196 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFDNP55196 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFDNP55196 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFDNP55196 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AFDNP55196 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFDNP55196 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFDNP55196 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFDNP55196 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AFDNP55196 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AFDNP55196 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms