Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPAP53621 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPAP53621 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPAP53621 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPAP53621 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COPAP53621 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COPAP53621 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COPAP53621 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COPAP53621 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COPAP53621 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms