Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCR4P51679 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCR4P51679 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCR4P51679 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCR4P51679 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCR4P51679 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCR4P51679 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCR4P51679 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCR4P51679 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCR4P51679 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCR4P51679 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms