Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE6CP51160 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE6CP51160 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms