Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PXNP49023 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PXNP49023 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PXNP49023 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PXNP49023 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PXNP49023 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXNP49023 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXNP49023 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PXNP49023 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms