Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PITPNBP48739 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PITPNBP48739 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms