Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK1A1P48729 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms