Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GCLMP48507 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GCLMP48507 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GCLMP48507 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GCLMP48507 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GCLMP48507 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GCLMP48507 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GCLMP48507 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms