Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX5P48382 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX5P48382 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX5P48382 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFX5P48382 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFX5P48382 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFX5P48382 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFX5P48382 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFX5P48382 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms