Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ME1P48163 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ME1P48163 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ME1P48163 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ME1P48163 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ME1P48163 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ME1P48163 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ME1P48163 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms