Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BRCC3P46736 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCC3P46736 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BRCC3P46736 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRCC3P46736 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms