Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACADSBP45954 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACADSBP45954 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms