Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NKX2-1P43699 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms