Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CRATP43155 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRATP43155 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRATP43155 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRATP43155 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRATP43155 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRATP43155 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRATP43155 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CRATP43155 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CRATP43155 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRATP43155 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRATP43155 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRATP43155 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRATP43155 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms