Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PBX2P40425 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PBX2P40425 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PBX2P40425 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PBX2P40425 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PBX2P40425 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PBX2P40425 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PBX2P40425 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PBX2P40425 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PBX2P40425 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PBX2P40425 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms