Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGHMBP2P38935 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHMBP2P38935 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms