Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB2P35606 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB2P35606 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB2P35606 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms