Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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HOXD13P35453 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD13P35453 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD13P35453 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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