Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXD12P35452 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms