Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA1P35221 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA1P35221 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms