Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GJA4P35212 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GJA4P35212 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA4P35212 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA4P35212 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA4P35212 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms