Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 TRM732YMR259C 4263 nt1.58□□□□□ -2.16
NIC96P34077 AHC1YOR023C 1701 nt1.58□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.58□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YOR345CYOR345C 351 nt1.58□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YBR206WYBR206W 324 nt1.58□□□□□ -2.16
NIC96P34077 ULI1YFR026C 510 nt1.57□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.57□□□□□ -2.16
NIC96P34077 MDS3YGL197W 4464 nt1.57□□□□□ -2.16
NIC96P34077 BRR2YER172C 6492 nt1.57□□□□□ -2.16
NIC96P34077 NUP145YGL092W 3954 nt1.56□□□□□ -2.16
NIC96P34077 PMD1YER132C 5262 nt1.56□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YDL196WYDL196W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
NIC96P34077 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.56□□□□□ -2.16
NIC96P34077 ROM2YLR371W 4071 nt1.56□□□□□ -2.16
NIC96P34077 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
NIC96P34077 APL3YBL037W 3078 nt1.55□□□□□ -2.16
NIC96P34077 FIG4YNL325C 2640 nt1.55□□□□□ -2.16
NIC96P34077 SPC110YDR356W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
NIC96P34077 SSK2YNR031C 4740 nt1.54□□□□□ -2.16
NIC96P34077 SET3YKR029C 2256 nt1.54□□□□□ -2.16
NIC96P34077 SLD3YGL113W 2007 nt1.54□□□□□ -2.16
NIC96P34077 snR52snR52 92 nt1.53□□□□□ -2.16
NIC96P34077 NUP188YML103C 4968 nt1.52□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.52□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YAR009CYAR009C 3591 nt1.52□□□□□ -2.17
NIC96P34077 SEC3YER008C 4011 nt1.52□□□□□ -2.17
NIC96P34077 PIK1YNL267W 3201 nt1.51□□□□□ -2.17
NIC96P34077 STO1YMR125W 2586 nt1.51□□□□□ -2.17
NIC96P34077 Q0092Q0092 141 nt1.51□□□□□ -2.17
NIC96P34077 RPL33BYOR234C 324 nt1.51□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.51□□□□□ -2.17
NIC96P34077 CHS1YNL192W 3396 nt1.51□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.5□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YLL020CYLL020C 306 nt1.5□□□□□ -2.17
NIC96P34077 COY1YKL179C 2040 nt1.49□□□□□ -2.17
NIC96P34077 PMP1YCR024C-A 123 nt1.49□□□□□ -2.17
NIC96P34077 HAL9YOL089C 3093 nt1.48□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.48□□□□□ -2.17
NIC96P34077 PET127YOR017W 2403 nt1.48□□□□□ -2.17
NIC96P34077 CDC25YLR310C 4770 nt1.47□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.47□□□□□ -2.17
NIC96P34077 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.46□□□□□ -2.18
NIC96P34077 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.45□□□□□ -2.18
NIC96P34077 SEC21YNL287W 2808 nt1.45□□□□□ -2.18
NIC96P34077 HKR1YDR420W 5409 nt1.45□□□□□ -2.18
NIC96P34077 FYV8YGR196C 2454 nt1.45□□□□□ -2.18
NIC96P34077 CCH1YGR217W 6120 nt1.45□□□□□ -2.18
NIC96P34077 EAF1YDR359C 2949 nt1.44□□□□□ -2.18
NIC96P34077 WAR1YML076C 2835 nt1.44□□□□□ -2.18
NIC96P34077 ATP8Q0080 147 nt1.43□□□□□ -2.18
NIC96P34077 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.43□□□□□ -2.18
NIC96P34077 STB6YKL072W 2301 nt1.43□□□□□ -2.18
NIC96P34077 NUP157YER105C 4176 nt1.42□□□□□ -2.18
NIC96P34077 RSM22YKL155C 1887 nt1.42□□□□□ -2.18
NIC96P34077 PAA1YDR071C 576 nt1.42□□□□□ -2.18
NIC96P34077 COA6YMR244C-A 315 nt1.42□□□□□ -2.18
NIC96P34077 RPS30BYOR182C 192 nt1.42□□□□□ -2.18
NIC96P34077 CDC39YCR093W 6327 nt1.42□□□□□ -2.18
NIC96P34077 YEL073CYEL073C 324 nt1.41□□□□□ -2.18
NIC96P34077 CAT8YMR280C 4302 nt1.41□□□□□ -2.18
NIC96P34077 COX12YLR038C 252 nt1.4□□□□□ -2.19
NIC96P34077 NUP192YJL039C 5052 nt1.38□□□□□ -2.19
NIC96P34077 SMC1YFL008W 3678 nt1.38□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.37□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YBL053WYBL053W 375 nt1.37□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YOR170WYOR170W 306 nt1.37□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YPL044CYPL044C 549 nt1.37□□□□□ -2.19
NIC96P34077 APL1YJR005W 2103 nt1.36□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.36□□□□□ -2.19
NIC96P34077 TTI1YKL033W 3117 nt1.36□□□□□ -2.19
NIC96P34077 GEA2YEL022W 4380 nt1.36□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YNL170WYNL170W 396 nt1.35□□□□□ -2.19
NIC96P34077 YNL211CYNL211C 261 nt1.35□□□□□ -2.19
NIC96P34077 PRP42YDR235W 1635 nt1.32□□□□□ -2.2
NIC96P34077 NOP9YJL010C 2001 nt1.32□□□□□ -2.2
NIC96P34077 KAP120YPL125W 3099 nt1.31□□□□□ -2.2
NIC96P34077 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.31□□□□□ -2.2
NIC96P34077 CMC4YMR194C-B 222 nt1.31□□□□□ -2.2
NIC96P34077 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.3□□□□□ -2.2
NIC96P34077 SDH6YDR379C-A 240 nt1.3□□□□□ -2.2
NIC96P34077 YGR164WYGR164W 336 nt1.3□□□□□ -2.2
NIC96P34077 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.29□□□□□ -2.2
NIC96P34077 MSH3YCR092C 3057 nt1.29□□□□□ -2.2
NIC96P34077 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.28□□□□□ -2.2
NIC96P34077 CDC31YOR257W 486 nt1.28□□□□□ -2.2
NIC96P34077 LAA1YJL207C 6045 nt1.28□□□□□ -2.21
NIC96P34077 BUD3YCL014W 4911 nt1.27□□□□□ -2.21
NIC96P34077 RAD9YDR217C 3930 nt1.27□□□□□ -2.21
NIC96P34077 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.27□□□□□ -2.21
NIC96P34077 ASE1YOR058C 2658 nt1.26□□□□□ -2.21
NIC96P34077 NST1YNL091W 3723 nt1.26□□□□□ -2.21
NIC96P34077 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.25□□□□□ -2.21
NIC96P34077 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.24□□□□□ -2.21
NIC96P34077 RPL26BYGR034W 384 nt1.23□□□□□ -2.21
NIC96P34077 PRP5YBR237W 2550 nt1.22□□□□□ -2.21
NIC96P34077 YLR282CYLR282C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
NIC96P34077 BFR2YDR299W 1605 nt1.22□□□□□ -2.21
NIC96P34077 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.21□□□□□ -2.22
NIC96P34077 COX5BYIL111W 456 nt1.21□□□□□ -2.22
NIC96P34077 YOR102WYOR102W 351 nt1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms