Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXA9P31269 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms