Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRIP30626 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRIP30626 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRIP30626 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRIP30626 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms