Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
CHRNA5P30532 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHRNA5P30532 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms