Protein–RNA interactions for Protein: P29056

BRF1, Transcription factor IIIB 70 kDa subunit, yeastyeast

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRF1P29056 YMR321CYMR321C 318 nt0.97□□□□□ -2.25
BRF1P29056 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.97□□□□□ -2.25
BRF1P29056 NHP2YDL208W 471 nt0.96□□□□□ -2.26
BRF1P29056 OLI1Q0130 231 nt0.96□□□□□ -2.26
BRF1P29056 snR36snR36 182 nt0.96□□□□□ -2.26
BRF1P29056 DBP6YNR038W 1890 nt0.96□□□□□ -2.26
BRF1P29056 UTP20YBL004W 7482 nt0.94□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.94□□□□□ -2.26
BRF1P29056 MCM10YIL150C 1716 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YER097WYER097W 330 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YFL032WYFL032W 321 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YFL063WYFL063W 456 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YKL118WYKL118W 312 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YOL014WYOL014W 375 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YOR282WYOR282W 321 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 NOP9YJL010C 2001 nt0.93□□□□□ -2.26
BRF1P29056 ECM12YHR021W-A 456 nt0.92□□□□□ -2.26
BRF1P29056 COG8YML071C 1824 nt0.92□□□□□ -2.26
BRF1P29056 ALG13YGL047W 609 nt0.91□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YIL032CYIL032C 357 nt0.91□□□□□ -2.26
BRF1P29056 CMC4YMR194C-B 222 nt0.91□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YPL044CYPL044C 549 nt0.91□□□□□ -2.26
BRF1P29056 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
BRF1P29056 YDR413CYDR413C 576 nt0.9□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YGL149WYGL149W 306 nt0.9□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YPR117WYPR117W 7470 nt0.9□□□□□ -2.27
BRF1P29056 ASE1YOR058C 2658 nt0.89□□□□□ -2.27
BRF1P29056 snR60snR60 104 nt0.89□□□□□ -2.27
BRF1P29056 PAA1YDR071C 576 nt0.89□□□□□ -2.27
BRF1P29056 RPS27BYHR021C 249 nt0.89□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YKL136WYKL136W 399 nt0.89□□□□□ -2.27
BRF1P29056 VIK1YPL253C 1944 nt0.89□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.88□□□□□ -2.27
BRF1P29056 RPL39YJL189W 156 nt0.88□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.88□□□□□ -2.27
BRF1P29056 BFR2YDR299W 1605 nt0.88□□□□□ -2.27
BRF1P29056 PMP1YCR024C-A 123 nt0.87□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YNL211CYNL211C 261 nt0.87□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YOR218CYOR218C 420 nt0.87□□□□□ -2.27
BRF1P29056 SGF11YPL047W 300 nt0.87□□□□□ -2.27
BRF1P29056 Q0142Q0142 177 nt0.86□□□□□ -2.27
BRF1P29056 IES4YOR189W 351 nt0.86□□□□□ -2.27
BRF1P29056 STE5YDR103W 2754 nt0.85□□□□□ -2.27
BRF1P29056 CSE2YNR010W 450 nt0.84□□□□□ -2.27
BRF1P29056 YMR160WYMR160W 2451 nt0.84□□□□□ -2.28
BRF1P29056 RPL26BYGR034W 384 nt0.83□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.83□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.82□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YOR015WYOR015W 360 nt0.81□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.81□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.8□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YNL028WYNL028W 318 nt0.8□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt0.79□□□□□ -2.28
BRF1P29056 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.78□□□□□ -2.28
BRF1P29056 MYO1YHR023W 5787 nt0.77□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.77□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.77□□□□□ -2.29
BRF1P29056 CHS6YJL099W 2241 nt0.76□□□□□ -2.29
BRF1P29056 NPR2YEL062W 1848 nt0.76□□□□□ -2.29
BRF1P29056 RAD61YDR014W 1944 nt0.76□□□□□ -2.29
BRF1P29056 SEC8YPR055W 3198 nt0.75□□□□□ -2.29
BRF1P29056 HAL9YOL089C 3093 nt0.75□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.75□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt0.75□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.75□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt0.74□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt0.74□□□□□ -2.29
BRF1P29056 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.73□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.73□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 snR190snR190 190 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 LTE1YAL024C 4308 nt0.72□□□□□ -2.29
BRF1P29056 FYV10YIL097W 1551 nt0.71□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.71□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt0.71□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt0.7□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YGR069WYGR069W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YNL146WYNL146W 303 nt0.7□□□□□ -2.3
BRF1P29056 PRP5YBR237W 2550 nt0.7□□□□□ -2.3
BRF1P29056 BIR1YJR089W 2865 nt0.7□□□□□ -2.3
BRF1P29056 snR65snR65 100 nt0.69□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt0.69□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YML002WYML002W 2214 nt0.68□□□□□ -2.3
BRF1P29056 snR74snR74 88 nt0.68□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YGL052WYGL052W 306 nt0.68□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.68□□□□□ -2.3
BRF1P29056 YPR092WYPR092W 306 nt0.67□□□□□ -2.3
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