Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms